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世界最大全腦神經(jīng)元三維數(shù)據(jù)庫建成數(shù)據(jù)量世界第一

來源:科技日報時間:2019-09-17 10:23:46

科技日報南京9月15日電 (金鳳)神經(jīng)元作為大腦的基礎組成單元,對研究大腦的結(jié)構(gòu)和功能至關(guān)重要。以往,受神經(jīng)元標注和成像技術(shù)的局限,得到的圖像有較高的噪聲和不均勻的信號。9月15日,在東南大學舉辦的2019神經(jīng)元重建及應用國際研討會中,科技日報記者獲悉,東南大學腦科學與智能技術(shù)研究院及東南大學-艾倫研究所腦數(shù)據(jù)聯(lián)合中心,近日開發(fā)了一套基于VR和AI技術(shù)的開源精準數(shù)據(jù)標注系統(tǒng)TeraVR,在全腦水平上重建出目前世界最大、最精確的神經(jīng)元三維結(jié)構(gòu),數(shù)據(jù)量世界第一。

想獲取神經(jīng)元形態(tài),通常需要做大腦細胞的稀疏標注、全腦成像、腦圖像可視化、神經(jīng)元形態(tài)重建等。其中,腦圖像的可視化與神經(jīng)元形態(tài)重建是整個流程中的瓶頸。東南大學腦科學與智能研究院客座教授王宜敏介紹,一個完整的小鼠全腦圖像通常占據(jù)數(shù)十個Terabytes,猴腦的全腦圖像更是達到Petabytes量級。同時,腦神經(jīng)元極為復雜的拓撲結(jié)構(gòu)也進一步增加了形態(tài)重建的難度。

“針對這些挑戰(zhàn),我們基于虛擬現(xiàn)實及人工智能技術(shù),設計并研發(fā)了一套開源的半自動化全腦神經(jīng)元重建系統(tǒng)TeraVR,能高效精確的從超大規(guī)模腦顯微圖像數(shù)據(jù)中,產(chǎn)生大量全腦神經(jīng)元形態(tài)結(jié)構(gòu)。”王宜敏介紹,科研人員用高分辨率顯微鏡為小鼠大腦切片拍照,再將小鼠大腦中的神經(jīng)元結(jié)構(gòu)提取出來,制作成精準的三維圖像。利用沉浸式的雙目立體成像,就可以更方便的觀察大腦結(jié)構(gòu),并從中分析出高度復雜的神經(jīng)元樹突及軸突的三維投射路徑。

王宜敏表示,“系統(tǒng)顯微圖像的分辨率精度能達到0.1—0.2微米,而且可以識別一些通用軟件中存在的重建缺失、過度重建、拓撲錯誤等問題。”他說,目前該系統(tǒng)已經(jīng)重建了1000多個完整的神經(jīng)元結(jié)構(gòu),數(shù)據(jù)量全球第一。

“對于大腦神經(jīng)元結(jié)構(gòu)的了解,可以為諸如帕金森癥、阿茲海默癥、漸凍癥等神經(jīng)退行性疾病的診斷治療,提供參考。”王宜敏說。

標簽: 全腦神經(jīng)

責任編輯:FD31
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